番茄脐腐果发病的根本是缺钙。沙性较大的土壤，盐基含量低，酸化，供钙不足；在盐渍化土壤中，虽然土壤含钙量较多，但因土壤可溶性盐类浓度高，根系对钙的吸收受阻，也会缺钙。施用铵态氮肥或钾肥过多时也会阻碍植株对钙的吸收。在土壤干旱，空气干燥，连续高温时易出现大量脐腐病果。因此可用护树大将军+根施通+钙肥灌根促进钙的吸收，同时起到预防作用。
番茄脐腐果发病的主要原因是水分供应失调。干旱条件下供水不足，忽旱忽涝，使番茄根系吸水受阻，由于蒸腾量大，果实中原有的水分被叶片夺走，导致果实大量失水，果肉坏死。此类情况应均衡浇水并喷施新高脂膜保温保湿预防病菌扩散和复制。
