研究所现有职工200余人，高级职称80人，研究员33人，其中具有博士学位人员50人。拥有中国工程院院士1人，国家自然科学基金杰出青年1人，拥有973首席专家1人，农业部现代农业产业技术体系首席专家2人。
下设10个研究室：种质资源研究室、十字花科研究室、茄科研究室、葫芦科研究室、栽培与采后技术研究室、植物保护研究室、生物技术研究室、花卉研究室、马铃薯研究室、质量安全与检测技术研究室。
研究所现有科研建筑面积1.8万平方米，有试验农场6个，总面积79公顷，其中有保护地面积10万平方米。全所拥有价值万元以上的设备940台（套），价值8600余万元，拥有国家种质资源中期库一座，保存有3.85万份蔬菜种质资源。
