中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所于1996年由中国农业科学院中兽医研究所（1958年建所）与中国农业科学院兰州畜牧研究所（1978年建所）合并成立，是一所涵盖畜牧、兽医、兽药、草业4大学科研究的综合性农业科研机构。2002年，研究所被科技部、财政部、中编办等三部委确定为非营利性科研机构。2007年，在农业部组织的“全国农业科研机构综合科研能力评估”中进入百强行列。2011年，在“十一五”全国农业科研机构科研综合能力评估中，研究所排名全国第44名、中国农业科学院第11名、甘肃省第1名、全国专业第4名、全国行业第4名。
研究所主要从事畜牧、兽医、兽药、草业4大学科10个重点方向的研究，设有畜牧研究室、兽药研究室、中兽医（兽医）研究室、草业饲料研究室4个研究部门。根据学科建设和科研工作的需要，按照专业、人才、科研任务、基础平台条件等内容，先后创建了兽药创新与安全评价1个农业农村部创新团队；牦牛资源与育种，细毛羊资源与育种，兽药创新与安全评价，兽用天然药物，兽用化学药物，寒生、旱生灌草新品种选育，奶牛疾病，中兽医与临床8个中国农业科学院科技创新团队。建成了省部级重点实验室和部院野外科学观测试验站等23个科技平台。编辑出版《中兽医医药杂志》和《中国草食动物科学》2个全国中文核心期刊。设有6个管理服务部门。
研究所所部在兰州市区，占地面积95亩，野外试验基地占地面积5476亩。拥有2栋总面积达17000平方米的科研大楼和6000平方米的科技培训中心；万元以上仪器设备370台（件）；科技期刊2万余册，图书3.35万余册（馆藏最早西文期刊出版于1838年，中文图书出版于明崇祯年间）；中草药标本1000余份，中兽医针具432件；植物标本314份，植物活体标本142份，牧草种子标本811份；动物毛、皮标本600余份。
研究所现有在职职工171人，离休职工4人，退休职工172人。在职职工中，有正高级21人，副高级53人；博士后4人，博士44人，硕士56人；博导8人，硕导39人；国家公益性行业专项首席科学家1人，国家支撑计划项目首席科学家1人，国家兽药审评专家委员会专家6人，国家畜禽遗传资源委员会委员1人，国家现代农业产业技术体系岗位科学家5人，国家有突出贡献中青年专家2人，国家百千万人才2人，农业部突出贡献专家1人，甘肃省优秀专家1人、甘肃省领军人才5人。1人被评为新中国成立60周年“三农”模范人物，3人荣获“新中国60年畜牧兽医科技贡献奖”。1入选农业农村部“农业科研杰出人才”；1人荣获第十二届中国青年科技奖，1人被评为“全国优秀科技工作者”，2人被评为“全国农业先进个人”。
在农业农村部、科技部、中国农科院和甘肃省的支持下，研究所紧紧围绕国家发展需求，自觉面向经济建设主战场，先后承担科研课题1670余项，获奖成果208项，其中国家奖12项，省部级奖159项；获得授权专利1125件，其中美国发明专利1件，国内发明专利188件，实用新型专利930件，外观专利6件；授权软件著作权60件；发表论文6271篇，SCI收录230篇，编写著作261部；培育畜禽新品种6个，牧草新品种10个；创制国家一类新兽药4个，获新兽药、饲料添加剂证书77个；制订国家及行业标准46项。研究所是中国毒理学会兽医毒理学专业委员会、中国畜牧兽医学会西北病理学分会、西北中兽医学分会、全国牦牛育种协作组挂靠单位。研究所与德、美、英、荷、澳、加等国的高等院校和科研机构建立了科技合作交流关系。
近年来，研究所先后获得“全国文明单位”“全国精神文明建设工作先进单位”“甘肃省文明单位”“中国农业科学院文明单位”“甘肃省绿化模范单位”等一系列荣誉称号。
